Postanowiono też, że w sezonie 2013/2014 Małopolska Liga Juniorów Starszych będzie liczyła 14 zespołów. Zabraknie w tym gronie trzech najlepszych, które będą reprezentować region w nowo utworzonej Centralnej Lidze Juniorów. Udział w CLJ mają już zapewniony Sandecja Nowy Sącz i Cracovia, tym trzecim będzie mistrz ligi małopolskiej po rundzie wiosennej.
Małopolska Liga Juniorów Młodszych w sezonie 2013/14 będzie się również składać z 14 drużyn.